蔡煜东,研究员,博士生导师

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从事生物信息学研究,先后被上海大学聘为“自强教授”、“特聘教授”。95年访问斯坦福大学,和美国科学院院士Samuel Karlin作序列分析研究;96年于德国EMBL作博士后,师从著名生物信息学家Peer Bork。共发表SCI论文290余篇,被引用11000余次,H指数达55,有一篇被Faculty1000评为“必读论文”;11篇高被引论文(ESI,其中1篇被评为“热点论文”(hot paper)。任 《BBA Proteins and Proteomics(IF=2.6),《Life (IF=2.99)等国际著名学术期刊责任编委。2009年被著名的“ISMB”国际会议聘为组委会委员。20162017年,入评英国皇家化学会“Top 1%高被引中国作者”。2019年,入选全球排名前十万名科学家榜单, 在19962017 的 “22 年综合榜”中,排名94664。2020年,再次入选全球排名前十万名科学家榜单,排名47069 2020年,入选Elsevier发布的“生化,遗传和分子生物学”学科中国高被引学者榜单。


工作经历

2014年至今,上海大学生命学院,研究员,博士生导师

2009年-2014年,上海大学系统生物技术研究所,特聘研究员,博士生导师

2007年-2009年,中国科学院,生命科学院计算生物学研究所,课题组长(PI),研究员,博士生导师

1998年-2007年,英国罗斯林研究所、威尔斯大学,曼彻斯特大学,研究助理

1996年-1998年,欧洲分子生物学实验室(EMBL),博士后

1995年-1996年,美国斯坦福大学(Stanford Univ.),访问学者

1990年-1995年,中国科学院,上海微系统研究所和中科院上海生物工程研究中心,助理研究员,副研究员


年代表性论文

1. Prediction and analysis of cell-penetrating peptides using pseudo-amino acid composition and random forest models. Chen L, Chu C, Huang T, Kong X, Cai YD. Amino Acids. 2015 Jul;47(7):1485-93. doi: 10.1007/s00726-015-1974-5. (他引49次)

2. Identification of compound-protein interactions through the analysis of gene ontology, KEGG enrichment for proteins and molecular fragments of compounds. Chen L, Zhang YH, Zheng M, Huang T, Cai YD. Mol Genet Genomics. 2016 Dec;291(6):2065-2079. (他引39次)

3. Gene expression profiling gut microbiota in different races of humans. Chen L, Zhang YH, Huang T, Cai YD. Sci Rep. 2016 Mar 15;6:23075. doi: 10.1038/srep23075.(他引39次)

实验室成员:


朱柳村


                                                       
   

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