蔡煜东教授实验室

创建时间:  2020/08/03     浏览次数:   

实验室名称:生物信息学实验室

实验室负责人简介

蔡煜东,教授,先后被上海大学聘为“自强教授”、“特聘教授”。95年访问斯坦福大学,和美国科学院院士Samuel Karlin作序列分析研究;96年于德国EMBL作博士后,师从著名生物信息学家Peer Bork。共发表SCI论文250余篇,被引用10000余次,H指数达53,有一篇被Faculty1000评为“必读论文”;11篇高被引论文(ESI),其中1篇被评为“热点论文”(hot paper)。任 《BBA Proteins and Proteomics》(IF=2.6)等国际著名学术期刊编委。2009年被著名的“ISMB”国际会议聘为组委会委员。2016和2017年,入评英国皇家化学会“Top 1%高被引中国作者”。2019年,入选全球排名前十万名科学家榜单, 在1996~2017 的 “22 年综合榜”中,排名94664。

团队成员:副教授:万嗣宝,朱柳村;讲师:王沂,李嘉睿。

主要研究领域:生物信息学,机器学习

代表性研究成果:

1. Prediction and analysis of cell-penetrating peptides using pseudo-amino acid composition and random forest models. Chen L, Chu C, Huang T, Kong X, Cai YD. Amino Acids. 2015 Jul;47(7):1485-93. doi: 10.1007/s00726-015-1974-5. (他引49次)

2. Identification of compound-protein interactions through the analysis of gene ontology, KEGG enrichment for proteins and molecular fragments of compounds. Chen L, Zhang YH, Zheng M, Huang T, Cai YD. Mol Genet Genomics. 2016 Dec;291(6):2065-2079. (他引39次)

3. Gene expression profiling gut microbiota in different races of humans. Chen L, Zhang YH, Huang T, Cai YD. Sci Rep. 2016 Mar 15;6:23075. doi: 10.1038/srep23075.(他引39次)

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